Bolesti koje zahvaćaju lucernu i djetelinu su trulež korijena i pjegavost lišća.
Trulež korijena lucerne i djeteline – Sclerotinia trifoliorum
Simptomi – U rano proljeće na podzemnom dijelu stabljike i korijenu, na nadzemnoj stabljici i lišću razvija se bijela nakupina micelija. U miceliju nastaju sklerocije. Bolesna su tkiva razmekšana, a biljke se suše.
Suzbijanje – Plodored 4-5 godina, smanjivanje vlažnosti tla odvodnjom (drenaža), bolesne biljke izvaditi i spaliti.
Pjegavost lišća lucerne i djeteline – Pseudopeziza medicaginis, P. trifolii
Simptomi – Bolest počinje na doljnjem lišću, a zatim se širi na ostalo lišće. Pjege su malene, okruglaste, smeđe do crne boje veličine 1-3 mm i uglavnom se ne spajaju. Nekrotični dio ponekada „ispada“ iz lista. Zaražene biljke ne ugibaju, ali je gubitak lisne mase značajan (manji prinos, loša kakvoća, smanjen vigor biljaka). Optimalni uvjeti za razvoj bolesti su visoka vlaga zraka i umjerene (čak i niže) temperature u proljeće i jesen.
Suzbijanje – Otporniji kultivari, ranija košnja u hladnijim i kišovitim godinama.